本所研究團隊策略性地區分為四個組別：淨零轉型、科技創新、數位經濟、國際網路；以協助政府與產業界共同面對當前國際政經局勢所帶來的挑戰。
淨零轉型組核心任務是整合能源與環境議題，促進各界對淨零轉型的理解與參與，確保政策制定兼顧經濟效益與社會正義。
科技創新組探索技術導入的樣貌、關鍵因素與影響，提出技術創新策略、政策影響與成效評估、產學鏈結合作、跨學科研究等。
數位經濟組的主要工作是研析全球數位科技的創新演化趨勢，以及新興數位科技對產業經濟和國家社會的發展影響，擘劃數位轉型與科技產業發展政策。
國際網絡組負責研究全球供應鏈網絡與國際貿易，尤其關注企業韌性及其對外部衝擊的應對策略，並積極促進跨國策略夥伴關係、知識交流與產業合作。